In silico
In silico — это метод компьютерной симуляции биологических процессов, который позволяет исследовать молекулярные взаимодействия, структуры белков, нуклеиновых кислот и других биомолекул без проведения реальных экспериментов. Термин «in silico» буквально переводится как «в кремнии», что символизирует использование компьютерных алгоритмов и симуляций для изучения биологических систем.
Метод in silico широко применяется в биохимии, молекулярной биологии и фармакологии для решения различных задач:
- проектирование новых лекарственных препаратов;
- изучение механизмов действия уже существующих лекарств;
- предсказание структуры белков и других макромолекул;
- анализ генетических последовательностей;
- моделирование биологических путей и сетей.
Преимущества метода in silico включают:
- возможность быстрого и недорогого получения результатов;
- возможность изучения систем на молекулярном уровне;
- возможность проведения виртуальных экспериментов, которые были бы невозможны или неэтичны в реальных условиях.
Однако у метода есть и ограничения:
- точность и достоверность результатов зависят от качества используемых моделей и алгоритмов;
- не все биологические процессы можно полностью воспроизвести в компьютерной модели;
- интерпретация результатов требует глубоких знаний в области биоинформатики и молекулярной биологии.
Список использованной научной литературы:
- Altschul S.F., Gish W., Miller W., Myers E.W., Lipman D.J. (1990). Basic local alignment search tool. Journal of Molecular Biology, 215(3), 403–410.
- Etzold T., Schomburg D., Bock C., Kloft S., Haufe S., Stegmaier M., et al. (2013). In silico drug discovery and development. Wiley Interdisciplinary Reviews: Computational Molecular Science, 3(6), 597–614.
- Hubbard T.J., Thornton J.M. (1998). Comparative molecular modelling and genomics. Current Opinion in Structural Biology, 8(2), 198–204.