Метод дробовика (shotgun experiment)

Метод дробовика (shotgun experiment) - Получение случайной массированной выборки клонированных фрагментов ДНК данного организма (т.е. «дробление» генома), на основе которых может быть составлена его геномная библиотека. Полученные в результате «метода дробовика» последовательности нуклеотидов после дополнительного клонирования могут быть использованы в различных генетических экспериментах.

Комментарии*

Метод дробовика (shotgun sequencing) - Метод секвенирования ДНК, при котором геном случайно фрагментируется на множество мелких участков, которые клонируются и секвенируются параллельно. Полученные последовательности затем собираются в полный геном с помощью компьютерных алгоритмов на основе перекрывающихся участков.

Дополнения:

  • Ключевой принцип: Отсутствие предварительного физического картирования генома перед секвенированием
  • Процесс: Включает этапы фрагментации ДНК, клонирования фрагментов, массового параллельного секвенирования и биоинформатической сборки
  • Применение: Широко использовался для секвенирования первых полных геномов, включая геном человека
  • Преимущества: Высокая скорость и эффективность для геномов с низким содержанием повторов
  • Ограничения: Сложность сборки в регионах с повторяющимися последовательностями
  • Современные аналоги: Лег в основу технологий секвенирования нового поколения (NGS)
*Подобраны с помощью LLM, верифицированы, но возможны неточности.
Ещё по теме
Библиотеки генов и секвенирование ДНК
Полимеразная цепная реакция в генной инженерии
Методы гомогенизации биологического материала
Методы клонирования ДНК
Лабораторный синтез дибромметана